Η ΕΑΔΠ ΑΠΘ διοικείται από επταμελές Διοικητικό Συμβούλιο, το οποίο ορίζεται από τη Σύγκλητο του ΑΠΘ.
Η τρέχουσα σύνθεση του Δ.Σ. της ΕΑΔΠ ΑΠΘ μέχρι 31-08-2022 είναι:
Πρόεδρος Δ.Σ.
Νικόλαος Γ. Παπαϊωάννου, Καθηγητής του Τμήματος Κτηνιατρικής ΑΠΘ, Πρύτανης ΑΠΘ
Αντιπρόεδρος Δ.Σ. και Διευθύνων Σύμβουλος
Δημήτριος Κουσενίδης, Καθηγητής του Τμήματος Οικονομικών Επιστημών ΑΠΘ
Αναπληρωτής Πρόεδρος Δ.Σ.
Χαράλαμπος Φείδας, Καθηγητής του Τμήματος Γεωλογίας ΑΠΘ, Αντιπρύτανης ΑΠΘ
Τακτικά Μέλη Δ.Σ.
Ανέστης Φιλιππίδης, Καθηγητής του Τμήματος Γεωλογίας ΑΠΘ
Κωνσταντίνος Μπίκος, Καθηγητής του Τμήματος Φιλοσοφίας Παιδαγωγικής ΑΠΘ
Πασχάλης Φορτομάρης, Καθηγητής του Τμήματος Κτηνιατρικής ΑΠΘ
Νικόλαος Κουλούσης, Καθηγητής του Τμήματος Γεωπονίας ΑΠΘ
Τηλέμαχος Καπετανίδης, εκπρόσωπος του Εμπορικού και Βιομηχανικού Επιμελητηρίου Θεσσαλονίκης
Αναπληρωματικά Μέλη Δ.Σ.
Ιωάννης Κυρίτσης, Αναπλ. Καθηγητής του Τμήματος Οικονομικών Επιστημών ΑΠΘ
Παναγιώτης Σπαθής, Καθηγητής του Τμήματος Χημείας ΑΠΘ
Κωνσταντίνος Χρήστου, Αναπλ. Καθηγητής του Τμήματος Ποιμαντικής και Κοινωνικής Θεολογίας ΑΠΘ
Γεώργιος Βαλεργάκης, Αναπλ. Καθηγητής του Τμήματος Κτηνιατρικής ΑΠΘ
Εμμανουήλ Χατζηπαντελής, Αναπλ. Καθηγητής του Τμήματος Ιατρικής ΑΠΘ
Κωνσταντίνα Κυργίδου, εκπρόσωπος του Εμπορικού και Βιομηχανικού Επιμελητηρίου Θεσσαλονίκης